Исследование MacroMap: как активация макрофагов помогает выявить генетические аспекты воспалительных заболеваний

Стимулируя макрофаги биологическими факторами, исследователи выявили генетические аспекты воспалительных заболеваний кишечника (ВЗК). Учёные раскрыли влияние генов на риск заболеваний, изучая иммунные клетки, активированные 24 раздражителями.

Получен набор данных MacroMap, новая карта генетических эффектов в иммунных клетках. Результаты указывают на необходимость изучения генов в контексте заболеваний с использованием более реалистичных методов.

Учёные использовали индуцированные плюрипотентные стволовые клетки человека, превращённые в макрофаги, и активировали их 24 различными стимулами. Затем измеряли экспрессию генов через 6 и 24 часа.

Исследование MacroMap показало, что 1955 случаев пересечения активности генов с генетическими вариантами заболеваний были бы упущены при использовании нестимулированных клеток. Например, генетический вариант, связанный с ишемической болезнью сердца, активирует ген CTSA только при воспалительных сигналах.