MaGNet: новый инструмент для анализа ветвлений в молочных железах

Ветвление характерно не только для деревьев, но и для животных, включая образование сложных структур в лёгких, почках, молочных железах и других органах. В молочных железах женщин ветвление усиливается в период полового созревания и беременности. Нарушения этого процесса связаны с раком молочной железы, однако его изучение сложно.

Исследователи из лаборатории Колд-Спринг-Харбор разработали инструмент MaGNet для количественной оценки изменений в молочных железах мышей. Система создана аспирантами Стивеном Льюисом, Люсией Теллес Перес и Самантой Генри и использует математическую модель для анализа ветвлений.

Обычно для анализа молочных желез требуется вырезать срезы ткани и вручную подсчитывать элементы. MaGNet автоматизирует процесс: исследователи отслеживают ветви, отображают их в виде сетей с помощью NetworkX, а компьютерный код анализирует сети, измеряя длину проводящей системы, количество протоков, альвеол и разветвлений.

Работа опубликована в Журнале биологии молочной железы и неоплазии. Возможно, MaGNet поможет изучать влияние гормонов и лечения на молочные железы или выявлять ранние признаки рака.