Применение современных методов для изучения клеток гиппокампа: результаты исследования

Гиппокамп поддерживает когнитивные процессы, включая память и обучение. Его структура и функции до конца не изучены. Современные методы, такие как транскриптомика с пространственным разрешением (SRT) и секвенирование одноклеточной РНК (snRNA-seq), позволяют детально исследовать клетки гиппокампа и их взаимосвязи.

Исследователи из Университета Джонса Хопкинса использовали SRT и snRNA-seq для изучения клеток гиппокампа 10 взрослых доноров. Они объединили данные с помощью неотрицательной матричной факторизации (NMF) и переноса меток, что позволило выявить паттерны экспрессии генов и пространственную организацию нейронов.

Результаты были сопоставлены с данными исследования гиппокампа мышей, что помогло охарактеризовать нейронные паттерны и кластеры малых ядерных РНК в различных регионах гиппокампа. Молекулярный атлас, созданный на основе исследования, доступен онлайн через интерактивное веб-приложение и может служить справочным материалом для будущих исследований.